Favignana è collegata con la Sicilia da due porti: Trapani e Marsala

Dal porto di Trapani è possibile imbarcarsi su gli aliscafi che partono con molta frequenza dalle ore 7,00 alle ore 19,30. Dal porto di Trapani è possibile utilizzare anche i traghetti in grado di trasportare oltre ai passeggeri, gli automezzi. Le corsa sono molto meno frequenti.

Dal porto di Marsala è possibile utilizzare unicamente il servizio aliscafi.

La compagnia che effettua tutti i servizi è www.libertylines.it

Gli aeroporti vicini sono:

Trapani/Birgi a circa 30 Km dal porto di Trapani e a circa 15 dal porto di Marsala.
Palermo/Falcone Borsellino a circa 70 Km dal porto di Trapani e a circa 60 dal porto di Marsala.